Le comité de pilotage est élu par l’Assemblée plénière. Il est composé de représentants de cinq associations algériennes et de trois associations françaises élus par tous les membres, auxquels s’ajoutent trois membres de droit  : les représentants des pouvoirs publics algériens et français et les représentants du CFSI, ONG garante du programme.

Elues par l’assemblée plénière en juin 2010 et pour un mandat de deux ans, les associations qui constituent le Copil pour la phase 2010-2012 sont :

• - Scouts Muslmans Algériens/ Réseau NADA (Alger)
  
• - L’association NOUR IMC (Oran)
  
• - L’ Association Etoile culturelle d’Akbou ( Béjaia)
  
• - L’association le Petit lecteur (Oran)
  
• - L’Association Nationale d’Echanges entre Jeunes (Alger)
  
• - Batik international (Paris)
  
• - Touiza solidarité (Marseille)
  
• - Le Plateau Mistral-Eaux Claires (Grenoble)
  

Ses prérogatives

De manière générale, le comité de pilotage :

• supervise la mise en œuvre du programme. La cellule exécutive lui rend compte régulièrement de son action et de l’état d’avancement du programme.
• valide la programmation se des activités transversales proposées par la cellule exécutive,
• se prononce éventuellement sur des ajustements proposés au budget initial du PCPA à la demande du chef de file,
• prépare et assure le bon déroulement des assemblées plénières

Le comité de pilotage est secondé par une équipe en Algérie et un chargé de programme en France (CFSI), qui travaillent en collaboration pour la mise en oeuvre et le suivi de l’ensemble des activités du programme.

Le rôle du chef de file

Le CFSI assure les fonctions de chef de file du PCPA. Il est signataire de la convention passée avec le ministère français des Affaires étrangères et européennes pour la mise en œuvre du programme. Il est responsable vis à vis du ministère, auquel il rend directement compte de la bonne gestion, de la bonne utilisation des fonds et du bon déroulement du programme.